🔍 L’article en bref
- +5,6 % de chiffre d’affaires en 2025, mais une pharmacie sur quatre recule : la hausse est un trompe-l’œil.
- Les médicaments chers pèsent 44 % du remboursable et expliquent quasiment toute la croissance, pour une marge d’environ 5 %.
- Raisonner en % du chiffre d’affaires n’a plus de sens : on pilote désormais en multiple de marge et d’EBE.
- La marge brute progresse de 3 % grâce aux honoraires, à la vaccination et à la concentration du réseau.
- L’EBE moyen remonte à environ 267 K€ et rattrape son niveau de 2023.
- Facture électronique : réception obligatoire au 1er septembre 2026, émission et e-reporting au 1er septembre 2027.
- Bien choisie, la plateforme agréée devient un outil de pilotage de la trésorerie et des marges arrière.
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1 905 officines passées au crible, près de 10 % du réseau français. C’est l’échantillon sur lequel le Conseil Gestion Pharmacie (CGP) a bâti ses statistiques 2025, présentées par les experts d’Extencia lors d’une soirée dédiée aux titulaires. Le verdict tient en une phrase : le chiffre d’affaires monte, mais il ne dit plus rien de la santé réelle d’une pharmacie.
Derrière les performances économiques des pharmacies en 2025, une mécanique discrète redistribue les cartes : envolée des médicaments chers, honoraires qui prennent le relais, frais de personnel sous tension. Et une échéance réglementaire majeure se profile : la facture électronique. Voici comment lire vos chiffres autrement, et comment transformer la réforme à venir en véritable outil de gestion.
Un chiffre d’affaires en hausse de 5,6 %… et pourtant trompeur
En 2025, le chiffre d’affaires moyen d’une officine atteint environ 2,66 millions d’euros, en progression de 5,6 % sur un an. Une belle dynamique, en apparence. Mais cette croissance masque des réalités contrastées qu’aucun titulaire ne peut ignorer pour piloter sa rentabilité d’officine.
📊 1 pharmacie sur 4 a vu son chiffre d’affaires reculer en 2025 — une proportion habituelle hors période Covid, signe que la moyenne cache de fortes disparités.
Ce que recouvre vraiment le chiffre d’affaires d’une officine
Le chiffre d’affaires d’une pharmacie ne se résume pas à la vente de boîtes. Il agrège plusieurs sources de revenus, dont le poids relatif évolue d’année en année.
- Les ventes : médicaments remboursables, automédication, parapharmacie, dispositifs médicaux.
- Les honoraires : honoraires de dispensation et honoraires à l’ordonnance.
- Les prestations et nouvelles missions : vaccination, tests, dépistages, entretiens pharmaceutiques.
- Les remises et RFA sur les génériques (remises de fin d’année, prestations commerciales).
En 2025, les ventes progressent d’environ 6 % (+130 000 €), malgré la baisse continue des prix du médicament, l’érosion du pouvoir d’achat et un climat de consommation peu porteur. Les honoraires, eux, repartent à la hausse après trois années de gel.
Pourquoi raisonner en pourcentage du CA n’a plus de sens
C’est le message le plus fort de la soirée CGP. Quand un médicament à 1 000 € entre dans le chiffre d’affaires pour une marge de quelques dizaines d’euros, regarder le CA brut devient trompeur. Aujourd’hui, dans une approche de valorisation ou d’acquisition d’officine, on ne raisonne quasiment plus en chiffre d’affaires, mais en multiple de marge et d’EBE.
💡 Le savoir-clé : raisonner en multiple de marge intègre automatiquement le poids des médicaments chers, ce que le CA brut est incapable de refléter.
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Médicaments chers : le moteur qui rogne la marge
Si une seule donnée devait résumer la transformation de l’économie officinale, ce serait celle-ci. Les médicaments chers (au-delà de 150 €) représentent désormais 44 % du chiffre d’affaires sur le médicament remboursable. Il y a dix ans, leur poids était trois fois moindre.
Un poids multiplié par trois en dix ans
Sur l’augmentation des ventes de 2025, la quasi-totalité provient de ces produits chers. Toutes catégories de TVA confondues, ils expliquent près de 90 % de la progression. Le volume de médicaments délivrés sur prescription a, lui, reculé de 2 %.
| Indicateur 2025 | Évolution | Lecture |
|---|---|---|
| Ventes | +6 % (≈ +130 000 €) | Tirées par les médicaments chers |
| Volume sur prescription | −2 % | Moins d’ordonnances, moins de lignes |
| Poids des médicaments chers | 44 % du remboursable | ×3 en 10 ans |
| Taux de marge sur ces produits | ≈ 5 % | Faible marge, trésorerie sous tension |
5 % de marge et une trésorerie sous tension
Le taux de marge sur les produits supérieurs à 150 € avoisine 5 %. Pour le titulaire, ces médicaments mobilisent une trésorerie importante : l’argent entre et ressort en quelques jours, alors que le règlement fournisseur intervient bien plus tard.
⚠️ Point de vigilance : certains titulaires refusent désormais des produits trop chers à faible marge, dont l’effet sur la trésorerie n’est pas compensé par la rentabilité dégagée.
Honoraires et nouvelles missions : les vrais relais
Heureusement, deux relais soutiennent la rentabilité. D’abord les honoraires à l’ordonnance, revalorisés au 1er janvier 2025 après trois ans de gel, à la suite de l’avenant conventionnel signé avec l’Assurance maladie en 2024. Ensuite les nouvelles missions, vaccination en tête.
📊 Lors de la campagne 2024-2025, près de 6 vaccins antigrippaux sur 10 ont été administrés en officine — la preuve que le rôle de soignant du pharmacien est entré dans les mœurs.
Les honoraires représentent aujourd’hui près de 10 % du chiffre d’affaires, mais surtout plus de la moitié de la marge sur le médicament et environ un tiers de la marge brute globale. Le pharmacien est passé du statut de commerçant à celui, hybride, de commerçant et professionnel de santé.
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Marge et EBE : la rentabilité réelle se redresse
On peut briller avec des pourcentages, mais on vit avec des euros. Le taux de marge moyen recule de près d’un point — logique au vu du poids des médicaments chers. En valeur, pourtant, la marge brute progresse d’environ 20 000 €, soit +3 %.
+3 % de marge brute malgré la baisse du taux
Trois facteurs expliquent ce redressement, selon les analyses du CGP relayées par Extencia :
- Le développement de la vaccination : environ un tiers de la hausse de marge.
- La revalorisation des honoraires à l’ordonnance.
- La concentration du réseau : moins d’officines se partagent la valeur.
Sur ce dernier point, le mouvement s’accélère : la France est passée sous la barre des 19 500 officines, avec environ 300 fermetures en 2025, soit 18 par mois. Toutes ne sont pas des fermetures sèches — certaines relèvent de regroupements — mais 251 n’ont pas trouvé de repreneur.
Frais de personnel : la pression se desserre
Les frais de personnel augmentent de 3,6 % (+10 000 €), soit deux fois moins vite que la marge. Un net soulagement après une année précédente où ils progressaient deux fois plus vite, faisant reculer l’EBE. Sur quatre ans, ils ont tout de même bondi de plus de 30 %.
| Charge 2025 | Évolution | Tendance sur 4 ans |
|---|---|---|
| Charges externes | +2,3 % | Hausse ralentie (vs ≈ +10 % en 2022) |
| Frais de personnel | +3,6 % (+10 000 €) | +30 % en 4 ans |
| EBE moyen | +3 % (≈ +9 000 €) | ≈ 267 K€, rattrape 2023 |
L’EBE rattrape son niveau de 2023
L’excédent brut d’exploitation, c’est la ressource qui reflète la rentabilité réelle de l’officine : elle rémunère le titulaire, rembourse les emprunts, paie l’impôt, et finance l’investissement. En 2025, il progresse d’environ 3 % pour s’établir autour de 267 000 €, retrouvant son niveau de 2023.
💡 Le savoir-clé : l’EBE est le seul indicateur qui dit si une officine vit correctement de son activité, indépendamment de son financement et de sa fiscalité.
Piloter son officine : les leviers concrets
Le constat est moins préoccupant qu’en 2024, mais la vigilance reste de mise, d’autant que les statistiques reflètent des bilans en partie arrêtés en 2024. Comment s’en sortir dans un contexte délicat ? Plusieurs leviers existent, et c’est tout l’enjeu d’un accompagnement spécialisé en expertise comptable pharmacie.
Marge par ETP, panier moyen et prix
Deux indicateurs méritent d’être suivis de près. La marge moyenne par équivalent temps plein s’établit autour de 114 000 € : trop basse, elle signale un effectif surcalibré ; très élevée, elle interroge sur la nécessité de recruter pour absorber la croissance. Le panier moyen hors ordonnance, lui, se situe en moyenne autour de 17 €.
✅ Bonne pratique : agissez de façon proactive sur vos prix. Si les laboratoires augmentent leurs tarifs, n’hésitez pas à répercuter pour préserver votre marge.
Spécialisation, nouvelles missions, regroupement
Au-delà du pilotage fin, des choix stratégiques s’imposent pour durer.
- Se spécialiser sur un segment (orthopédie, dermo-cosmétique, nutrition…) pour se démarquer et capter une clientèle fidèle.
- Développer les nouvelles missions, sous réserve de disposer des ressources humaines et des locaux adaptés.
- Repenser le maillage et étudier un regroupement avec des confrères pour atteindre la taille critique et mieux valoriser l’outil à la revente.
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Facture électronique : l’échéance du 1er septembre 2026
C’est le second sujet brûlant de la rentrée. La facture électronique devient obligatoire et concerne toutes les entreprises assujetties à la TVA, officines comprises. Mieux vaut l’anticiper que la subir.
Réception en 2026, émission en 2027
| Échéance | Obligation | Pour la pharmacie |
|---|---|---|
| Dès aujourd’hui | Inscription à l’annuaire centralisé | Validation de la plateforme agréée (CERFA) |
| 1er septembre 2026 | Réception des factures électroniques | Factures laboratoires et grossistes reçues automatiquement |
| 1er septembre 2027 | Émission + e-reporting | Rétrocessions, EHPAD, mairies, ticket Z quotidien |
e-invoicing et e-reporting : deux volets à distinguer
La réforme repose sur deux mécanismes complémentaires. Bien les comprendre évite les contresens.
- L’e-invoicing : l’émission, la transmission et la réception des factures entre professionnels (B2B), via des plateformes agréées.
- L’e-reporting : la transmission à l’administration des données de vente aux particuliers (B2C). Concrètement, vos tickets sont compilés en un ticket Z quotidien, transmis tous les dix jours.
Plateforme agréée : une seule, à bien choisir
Chaque officine ne peut désigner qu’une seule plateforme agréée de réception, identifiée par son numéro de SIRET dans l’annuaire centralisé. Attention aux sollicitations multiples : banques, prestataires divers proposent leur propre plateforme au détour d’une connexion.
⚠️ Point de vigilance : ne validez pas plusieurs plateformes par inadvertance. Une sélection erronée se corrige, mais la désinscription auprès de l’annuaire reste une démarche fastidieuse.
Pour les officines, des solutions métier comme Digipharmacie, déjà déployée dans une large majorité du réseau, font office de plateforme agréée et centralisent les factures fournisseurs en un seul endroit. L’enjeu : ne rien changer au quotidien, tout en gagnant en conformité.
Vous ignorez quelle plateforme agréée désigner ? Faites le point avec votre expert-comptable.
Transformer la réforme en outil de pilotage
Une réforme imposée n’enthousiasme personne. Pourtant, bien exploitée, la dématérialisation peut devenir un atout de gestion concret pour piloter votre officine au jour le jour. C’est là que les solutions digitales changent la donne.
Visibilité, archivage et échéancier
Fini les factures éparpillées dont on ignore le statut. La centralisation offre une vue claire : facture payée ou non, date d’échéance, acceptée ou rejetée. L’archivage conforme (norme NF Z42-013 et durée de 10 ans) est assuré, prêt en cas de contrôle fiscal.
- Échéancier de trésorerie : visualiser quelle facture est payée quel jour, et avancer ou retarder un règlement au besoin.
- Analyse des RFA : être alerté quand un fournisseur modifie une remise négociée en début d’année.
- Suivi des prix par article : comparer l’historique d’achat entre grossistes et laboratoires.
Litige plutôt que refus
Nuance importante dans le nouveau cadre : refuser une facture l’annule entièrement et contraint le laboratoire à se justifier auprès de l’administration. À réserver aux cas majeurs (mauvais adressage, retour intégral).
✅ Bonne pratique : en cas de problème de prix, de remise ou de quantité, créez un litige plutôt que de refuser la facture. C’est un circuit plus fluide pour négocier un avoir.
Anticiper avec votre expert-comptable
La réforme structure encore davantage la relation entre l’officine et son cabinet. Tableaux de bord d’achats, suivi des engagements et des seuils de RFA, analyse de marge en temps quasi réel : l’expert-comptable devient le partenaire qui transforme la donnée en décisions. Nos équipes de Bordeaux et d’Anglet, autour de Thomas Grosse, accompagnent les titulaires sur ces deux fronts.
Votre prochain rendez-vous avec la performance
Le chiffre d’affaires ne raconte plus votre officine. La marge, l’EBE, la marge par ETP, le pilotage des achats : voilà les véritables boussoles de 2025, et la facture électronique va en devenir un instrument de mesure quotidien. Encore faut-il les lire avec un œil expert.
Membre du réseau CGP, fort de plus de 40 ans d’accompagnement des pharmaciens et de 80 ans d’expertise depuis 1944, Extencia met cette lecture au service de votre rentabilité. Anticipez la réforme, optimisez vos marges, valorisez votre officine. Réservez votre consultation gratuite dès maintenant.
Pourquoi le chiffre d’affaires des pharmacies augmente-t-il alors que la rentabilité stagne ?
Parce que la hausse du chiffre d’affaires est portée à près de 90 % par les médicaments chers, dont la marge avoisine 5 %. Le CA progresse de 5,6 % en 2025, mais cette croissance dégage peu de marge. C’est pourquoi on pilote désormais une officine en multiple de marge et d’EBE, pas en chiffre d’affaires brut.
Quel est le chiffre d’affaires moyen d’une pharmacie en 2025 ?
Le chiffre d’affaires moyen d’une officine s’établit autour de 2,66 millions d’euros en 2025, en progression de 5,6 % sur un an, selon les statistiques du Conseil Gestion Pharmacie (CGP) portant sur près de 10 % du réseau français. Une pharmacie sur quatre voit toutefois son CA reculer.
Quel est le poids des médicaments chers dans une officine ?
Les médicaments dont le prix dépasse 150 € représentent environ 44 % du chiffre d’affaires sur le médicament remboursable en 2025, contre trois fois moins il y a dix ans. Leur taux de marge avoisine 5 % et ils mobilisent fortement la trésorerie de l’officine.
À quelle date la facture électronique devient-elle obligatoire pour les pharmacies ?
Les pharmacies devront recevoir leurs factures fournisseurs au format électronique dès le 1er septembre 2026. L’obligation d’émettre des factures et de transmettre les données de vente (e-reporting) s’applique à compter du 1er septembre 2027 pour la quasi-totalité des officines.
Quelle est la différence entre e-invoicing et e-reporting ?
L’e-invoicing concerne l’émission, la transmission et la réception des factures entre professionnels (B2B) via des plateformes agréées. L’e-reporting concerne la transmission à l’administration des données de vente aux particuliers (B2C) : les tickets sont compilés en un ticket Z quotidien, transmis tous les dix jours.
Combien de plateformes agréées une pharmacie peut-elle choisir ?
Une seule plateforme agréée de réception par officine, rattachée à son numéro de SIRET dans l’annuaire centralisé. Il faut donc se méfier des sollicitations multiples (banques, prestataires) qui proposent leur propre plateforme. Une sélection erronée se corrige, mais la désinscription est fastidieuse.
Comment Extencia accompagne-t-il les pharmaciens ?
Membre du réseau CGP et fort de plus de 40 ans d’expérience auprès des officines, Extencia accompagne les pharmaciens de l’installation à la transmission : analyse de marge et d’EBE, pilotage des achats, valorisation, et mise en conformité avec la facture électronique. Le cabinet s’appuie sur des outils métier comme Digipharmacie et des équipes dédiées à Bordeaux, Anglet, Lyon, Toulouse et Grenoble.
