Pénuries et préparations magistrales en 2026 : réglementation, remboursement et rentabilité

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Sommaire

🔍 L’article en bref

  • Trois catégories distinctes : magistrales, officinales et POS — créées par le décret 2025-760 pour répondre aux pénuries.
  • BPP 2023 obligatoires : référentiel opposable ANSM en vigueur depuis septembre 2023.
  • Habilitation ARS : obligatoire pour les préparations à risque, accordée après inspection.
  • Trois codes AM : PMR (65 %), PM2 (15 %, sans usage depuis 2008), PM4 (30 %) — mention prescripteur obligatoire sur toute ordonnance.
  • Les indus sont évitables : documenter le contexte de pénurie, vérifier la mention prescripteur et utiliser des MP pharmacopéales.
  • Calculer le coût réel s’impose : MP, main-d’œuvre chargée, amortissements, contrôles — beaucoup d’officines sous-valorisent leur activité préparatoire.
  • Un levier stratégique à saisir : l’officine préparatrice bien gérée se différencie, fidélise les prescripteurs et valorise son fonds de commerce.

En 2025, plus de 5 000 médicaments ont été signalés en rupture ou en tension d’approvisionnement en France — un record. Face à l’indisponibilité de spécialités aussi courantes que l’amoxicilline ou la quétiapine, les officines préparatrices ont joué un rôle d’amortisseur sanitaire. Mais derrière la prouesse technique, une réalité économique s’impose : beaucoup de pharmaciens titulaires ne valorisent pas — ou mal — cette activité qui peut pourtant représenter un levier de différenciation et de revenus complémentaires significatifs.

Le décret n° 2025-760 du 4 août 2025 a rebattu les cartes en créant un nouveau cadre pour les préparations officinales spéciales en contexte de pénurie. Simultanément, les organisations professionnelles USPO, Les PREF et SN2P ont adressé en mars 2026 une note conjointe aux caisses d’assurance maladie pour clarifier les règles de remboursement — signal fort que ce sujet cristallise des enjeux majeurs pour l’officine.

Ce guide vous donne les clés pour maîtriser le cadre réglementaire, sécuriser votre facturation et piloter votre activité préparatoire comme un véritable levier de performance.

1. Magistrales, officinales, POS : les distinctions qui changent tout

La préparation magistrale : définition et portée légale

La préparation magistrale est tout médicament élaboré selon une prescription médicale destinée à un patient nommément identifié, lorsqu’aucune spécialité pharmaceutique adaptée ou disponible n’existe. Elle est réalisée sous la responsabilité du pharmacien dispensateur, qui engage sa responsabilité pharmaceutique et pénale sur la qualité du produit final.

À ne pas confondre avec la préparation officinale, qui correspond à un médicament préparé en avance, inscrit à la pharmacopée ou au formulaire national, et destiné à être dispensé directement aux patients de l’officine — sans prescription individuelle nominative.

Les préparations officinales spéciales (POS) : la nouveauté du décret 2025-760

Avec le décret n° 2025-760 du 4 août 2025, le législateur a créé une troisième catégorie : les préparations officinales spéciales (POS). Ce dispositif exceptionnel peut être activé par le ministre de la Santé, sur avis du directeur général de l’ANSM, lorsqu’un médicament industriel n’est plus disponible.

La POS autorisée bénéficie d’une monographie publiée sur le site de l’ANSM. En contrepartie, les officines qui en réalisent sont soumises à un bilan mensuel transmis à l’ARS et à l’ANSM, et les préparations ne peuvent être dispensées qu’aux patients du prescripteur désigné.

⚠️ Point de vigilance — Si aucune alternative pérenne n’est identifiée par l’ANSM, elle peut exiger le transfert de l’exploitation à un établissement pharmaceutique public, renouvelable tous les deux ans. Anticipez ce risque dans votre stratégie préparatoire.

TypeBase légalePrescription nominativeMonographie publiéeDestinataire
MagistraleCode de la Santé PubliqueOuiNonPatient désigné
OfficinalePharmacopée / formulaire nationalNonOuiPatients de l’officine
Officinale spéciale (POS)Décret 2025-760OuiOui (ANSM)Patients du prescripteur désigné

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2. Les BPP et l’habilitation ARS : vos obligations concrètes

Le référentiel BPP 2023 de l’ANSM

Depuis leur entrée en vigueur le 20 septembre 2023, les nouvelles Bonnes Pratiques de Préparation (BPP) de l’ANSM constituent le référentiel opposable pour toutes les préparations pharmaceutiques en officine. Ces BPP renforcent quatre axes : qualification des équipements, gestion documentaire, contrôles qualité et exigences environnementales. L’ensemble des matières premières entrant dans une préparation remboursable doit être inscrit à la pharmacopée française ou européenne.

💡 Le savoir-clé — Toute préparation magistrale qui utilise des matières premières non inscrites à la pharmacopée ne peut pas bénéficier du remboursement Assurance Maladie. Ce point est fréquemment à l’origine de refus de prise en charge ou d’indus.

Habilitation ARS : qui la demande et dans quel délai

L’exécution de préparations présentant un risque particulier pour la santé — préparations stériles, cytotoxiques ou principes actifs sensibles — est soumise à autorisation préalable du directeur général de l’ARS. Cette autorisation n’est accordée qu’après inspection et précise les formes pharmaceutiques et activités autorisées.

La sous-traitance : encadrement strict et responsabilités partagées

La sous-traitance à un laboratoire autorisé est légalement possible, mais strictement encadrée :

  • Le sous-traitant doit être lui-même autorisé par l’ARS pour les activités concernées
  • Un contrat de sous-traitance définissant le partage des responsabilités doit être formalisé
  • Le pharmacien donneur d’ordre reste garant de la qualité du produit final vis-à-vis du patient
  • La traçabilité de la sous-traitance doit figurer dans le dossier de la préparation
  • Le prix de cession entre officines doit être documenté pour la facturation AM

Bonne pratique — En cas de sous-traitance, conservez l’intégralité des documents de traçabilité (BL, certificat d’analyse, contrat) dans le dossier de préparation. En cas de contrôle ou de contestation d’un indu, ce dossier est votre première ligne de défense.

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Inspection ARS d'une officine préparatrice dans le cadre des Bonnes Pratiques de Préparation BPP 2023

3. Remboursement AM : maîtriser les codes et éviter les indus

Les trois conditions cumulatives du remboursement

Pour qu’une préparation magistrale soit prise en charge par l’Assurance Maladie, trois conditions doivent être simultanément remplies.

Première condition : la préparation doit figurer parmi les préparations remboursables listées par arrêté ministériel, ou entrer dans le cadre d’une dispensation justifiée par la pénurie d’une spécialité disponible.

Deuxième condition : le prescripteur doit avoir apposé sur l’ordonnance la mention obligatoire : “prescription à visée thérapeutique en l’absence de spécialité équivalente disponible”. Son absence entraîne systématiquement un rejet.

Troisième condition : les matières premières utilisées doivent toutes être inscrites à la pharmacopée française ou européenne.

⚠️ Point de vigilance — Des remboursements de préparations magistrales réalisées en contexte de rupture, sans recommandation officielle signée, ont été requalifiés en indus. Documentez systématiquement le contexte de pénurie (signalement ANSM, arrêté de rupture) au dossier.

Codes PMR, PM2, PM4 : le bon code au bon moment

CodeTaux de remboursementConditions d’application
PMR65 %Préparations sur liste positive, hors exception
PM215 %Sans usage réel depuis le 1er janvier 2008
PM430 %Médicaments à SMR modéré ou faible

💡 Le savoir-clé — La base de remboursement AM pour une préparation magistrale est calculée sur le coût des matières premières entrant dans sa composition, auquel s’ajoute un forfait de rémunération pharmaceutique. Ce calcul doit être précis et documenté pour éviter tout redressement.

Sécuriser la facturation et prévenir les indus

Plusieurs erreurs sont récurrentes lors des contrôles AM :

  • Mention prescripteur absente : première cause de rejet — vérifiez l’ordonnance avant exécution
  • Matière première non pharmacopéale : source de contestation sur la recevabilité du remboursement
  • Code AM incorrect : génère des régularisations parfois défavorables
  • Absence de contexte de pénurie documenté : en l’absence d’arrêté ou de signalement ANSM, la justification est fragile

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Pharmacien vérifiant les codes de remboursement AM d'une préparation magistrale — codes PMR PM4

4. Pénuries 2026 : un contexte qui redessine les équilibres

Amoxicilline, quétiapine : les cas qui ont changé la pratique

La pénurie d’amoxicilline de 2022-2023 a marqué un tournant : pour la première fois, des officines préparatrices ont dû produire à grande échelle des suspensions buvables pédiatriques en urgence. La quétiapine — antipsychotique atypique largement prescrit — a connu des tensions similaires, exposant les patients psychiatriques à des ruptures de traitement.

📊 5 000+ médicaments signalés en rupture ou tension d’approvisionnement en France en 2025, selon les données de l’ANSM — un record historique qui interroge la dépendance au modèle industriel.

Les nouvelles POS : une opportunité stratégique pour l’officine préparatrice

Pour les officines déjà équipées et habilitées, le dispositif POS représente une opportunité de positionnement :

  • Renforcer la relation avec les prescripteurs locaux (médecins généralistes, psychiatres, pédiatres)
  • Développer un savoir-faire reconnu et différenciant face à la concurrence
  • Valoriser une activité à forte valeur ajoutée pharmaceutique — et comptable

Sécuriser la relation avec les prescripteurs

  • Informer les prescripteurs de votre habilitation et de vos capacités (fiche technique officine)
  • Proposer un retour systématique sur chaque préparation réalisée (délai, lot, contrôles)
  • Rappeler la mention obligatoire à inscrire sur l’ordonnance
  • Constituer un réseau de prescripteurs référents pour les préparations récurrentes

Bonne pratique — Organisez une rencontre semestrielle avec vos prescripteurs référents pour faire le point sur les pénuries en cours et les préparations que vous pouvez proposer. Ce type d’échange renforce votre positionnement d’expert local et génère un flux de prescriptions plus régulier.

Rupture de stock en pharmacie — pénurie médicaments amoxicilline quétiapine 2026

5. Piloter et valoriser votre activité préparatoire

Calculer le coût réel d’une préparation

ComposanteExemple de valorisation
Matières premières (MP)Coût d’achat + part de conditionnement consommé
Main-d’œuvre pharmaceutiqueTemps préparateur × coût horaire chargé
Coût des contrôles qualitéRéactifs, équipements, temps technicien
Amortissement du matérielHottes, balances, étuve, autoclave…
Gestion administrativeDossier de lot, déclaration ARS/ANSM (pour les POS)
Marge pharmaceutiqueÀ définir selon le positionnement de l’officine

💡 Le savoir-clé — La valorisation d’une heure de préparateur inclut salaire brut, charges patronales, formation continue et quote-part des frais fixes. Un calcul réaliste aboutit souvent à un coût horaire de 35 à 50 € chargé. Intégrez ce chiffre dans votre tarification.

Intégrer l’activité préparatoire dans votre tableau de bord

Trois indicateurs clés à suivre mensuellement :

  • CA préparatoire (AM + participations patient) : objectif réaliste pour une officine active — 3 à 8 % du CA total
  • Taux de préparations remboursées : un taux inférieur à 80 % doit alerter sur des problèmes documentaires ou de codification
  • Délai moyen de réalisation : impacte satisfaction prescripteur, patient et coût de main-d’œuvre

L’accompagnement d’un expert-comptable spécialisé pharmacie

L’activité préparatoire soulève des questions comptables spécifiques : amortissement du matériel de laboratoire, comptabilisation des stocks de matières premières, traitement des indus AM, valorisation dans le cadre d’une cession ou d’une évaluation d’officine.

Un expert-comptable spécialisé en pharmacie — membre du réseau CGP notamment — vous aide à construire un compte de résultat analytique séparant l’activité préparatoire des autres flux, à documenter les investissements pour optimiser leur traitement fiscal, et à sécuriser la facturation dans le cadre des contrôles AM.

Votre expert-comptable est-il vraiment expert de votre secteur ? La pharmacie a ses propres règles — comptables, fiscales, réglementaires.

Vous souhaitez un diagnostic de votre activité préparatoire ? Contactez nos équipes spécialisées pharmacie à Bordeaux, Lyon, Toulouse ou Anglet.

Expert-comptable spécialisé Pharmacie

Votre officine préparatrice : une valeur à développer

Les pénuries de médicaments ne sont pas une parenthèse : elles sont structurelles. La dépendance aux chaînes d’approvisionnement internationales, la pression sur les prix des génériques et la complexification des traitements chroniques dessinent un futur où les officines préparatrices joueront un rôle croissant dans la continuité des soins.

Transformer ce rôle en performance économique réelle demande une double maîtrise : celle du cadre réglementaire — en perpétuelle évolution depuis le décret 2025-760 — et celle des outils de gestion adaptés. Extencia accompagne les pharmaciens titulaires depuis 40 ans, avec une expertise reconnue au sein du réseau CGP et des outils dédiés comme Digipharmacie et ViewPharma.

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Questions fréquentes

Qu’est-ce qu’une préparation magistrale en pharmacie ?

Une préparation magistrale est un médicament réalisé par le pharmacien selon une prescription médicale individuelle, au nom d’un patient précisément identifié, lorsqu’aucune spécialité adaptée ou disponible n’existe. Le pharmacien en est entièrement responsable pharmaceutiquement, et la préparation doit être réalisée conformément aux BPP de l’ANSM.

Quelles conditions pour que l’AM rembourse une préparation magistrale ?

Trois conditions cumulatives : (1) la préparation figure sur la liste des préparations remboursables ou est justifiée par l’indisponibilité d’une spécialité ; (2) le prescripteur a inscrit la mention obligatoire “prescription à visée thérapeutique en l’absence de spécialité équivalente disponible” ; (3) toutes les matières premières sont inscrites à la pharmacopée.

À quoi correspondent les codes PMR, PM2 et PM4 ?

Codes de facturation AM pour les préparations magistrales remboursables. PMR = remboursement à 65 %, PM4 = 30 %. PM2 (15 %) existe théoriquement mais n’est plus appliqué depuis le 1er janvier 2008. Une erreur de codification peut générer des indus ou des régularisations défavorables.

Qu’est-ce que le décret 2025-760 a changé pour les pénuries ?

Il a créé les “préparations officinales spéciales” (POS), activables par le ministre de la Santé avec une monographie ANSM, permettant aux officines autorisées de produire en contexte de pénurie avec bilan mensuel ARS/ANSM obligatoire. Le remboursement se fait au même taux que la spécialité manquante.

Une officine peut-elle sous-traiter ses préparations magistrales ?

Oui, entre établissements autorisés, avec un contrat formalisant le partage des responsabilités. Le pharmacien donneur d’ordre reste garant de la qualité finale. Toute la traçabilité doit être conservée dans le dossier de préparation pour justifier la facturation AM.

Comment calculer le coût réel d’une préparation magistrale ?

Le coût complet intègre : matières premières, main-d’œuvre chargée (temps × coût horaire réel incluant charges), contrôles qualité, amortissement du matériel et quote-part de frais fixes. Sans ce calcul, impossible de savoir si l’activité préparatoire est rentable.

Pourquoi faire appel à un expert-comptable spécialisé pharmacie pour l’activité préparatoire ?

L’activité préparatoire génère des enjeux comptables spécifiques : traitement des indus AM, amortissement du matériel, valorisation des stocks de matières premières et impact sur l’évaluation du fonds lors d’une cession. Un expert membre du CGP maîtrise ces subtilités et vous aide à piloter cette activité avec des indicateurs adaptés.

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